Zgodność odnosi się do sześciu protein zwanych antygenami układu HLA, które występują na powierzchni białych ciałek krwi. Tych sześć punktów, czyli loci wpływa na zgodność tkanki pomiędzy dawcą a biorcą. Chociaż zgodność absolutna byłaby najlepsza, badania wykazały, iż przeszczepy krwi pępowinowej kończą się powodzeniem, nawet jeśli 3 na 6 loci są zgodne.