GVHD - tzw. "przeszczep przeciwko gospodarzowi" polega na tym, że przeszczepione limfocyty B dawcy, w organizmie biorcy działają wg. swojego dotychczasowego "zaprogramowania" i rozpoznają komórki organizmu biorcy jako obce. Wówczas wytwarzają się przeciwciała przeciwko komórkom biorcy, a te niszczą wszystkie komórki zawierające antygeny rozpoznane jako obce przez limfocyty dawcy, a więc praktycznie wszystkie komórki organizmu biorcy. GVHD czyli odrzucenie przeszczepu jest główną przyczyna zgonów u pacjentów po przeszczepach głównie z krwi obwodowej i szpiku kostnego.